Photo de la nef et ses arcades en plein-cintre qui la sépare des bas-côtés, face à l'orgue Silbermann de l'église Saint-Jean-Baptiste, à Saint-Jean-Saverne. Description de l'intérieur de l'église Saint-Jean-Baptiste de Saint-Jean-Saverne.

L'intérieur de l'église Saint-Jean-Baptiste de Saint-Jean-Saverne comprend 3 vaisseaux terminés par des absides demi-circulaires. La nef centrale est munie de cinq travées voûtées de lourdes croisées d'ogives reposant sur des colonnettes et sur des culots en forme de tête. Elle comprend un orgue de Jean-André Silbermann remanié en 1904 par Edmond-Alexandre Roethinger et en 2009 par Richard Dott. La chaire baroque du XVIIIe siècle en bois polychrome possède une cuve ornée des quatre évangélistes et de leurs symboles; sur le dorsal, Saint Paul tient le glaive et les évangiles, il est surmonté de la colombe du Saint-Esprit. À côté de la chaire se trouve un tableau de l'abbesse Odile von Peyerimhof qui a dirigé le couvent de 1734 à 1756. Les deux autels latéraux sont dédiés à Saint Jean le Baptiste côté Sud et à la Vierge Marie au Nord; réalisés en 1770 en bois polychrome, ils épousent également un style baroque. La nef centrale est séparée des bas-côtés par des arcades en plein-cintre qui reposent sur des piliers carrés. Le bas-côté Nord abrite une très belle statue de procession de la Vierge de l'Immaculée Conception de style rococo en bois doré et argenté. Le choeur en cul-de-four de l'église Saint-Jean-Baptiste comprend un maître-autel baroque en bois doré de 1763, oeuvre du menuisier Schweighauser et du sculpteur Ketterer, il est surmonté sur le plafond d'une illustration de la Trinité, avec au centre l'oeil de Dieu. Le choeur est illuminé par 3 verrières en plein-cintre illustrées par les vitraux de Sainte Agathe côté Nord, Saint Jean Baptiste au centre et l'archange Saint Michel côté Sud. Dans le bas-côté Sud du choeur se trouve la porte d'entrée de la sacristie, elle donnait autrefois dans le cloître. Magnifiquement sculptée, elle est surmontée d'un tympan semi-circulaire monolithe bordé d'un rinceau de palmettes encadrant la scène de l'agneau mystique nimbé tenant la croix entre deux arbres stylisés et deux étoiles à cinq branches. Les montants sont également ornés de rinceaux de palmettes chargées de raisins sur le montant de gauche. Autres trésors de l'édifice, les tapisseries du XVIe siècle dans la sacristie Nord, elles représentent: le Jugement de Salomon, la Mise au Tombeau, la Madone au Jardinet, les Lamentations du Vieillard, le Trône de Grâce, le Voile d'Armoire Eucharistique, le Couronnement de la Vierge et la Chasse des Hommes Sauvages. L'église catholique Saint-Jean-Baptiste de Saint-Jean-Saverne figure sur la liste initiale des Monuments Historiques depuis 1840, elle a été classée le 16 février 1930.